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擬鳥VR飛行：在空中飛行是潛藏於人類心底最深處、最久遠的渴望之一。過去人類只能在腦海中想像鳥類飛行時的感受，試圖去猜想看到、聽到、感覺到的一切，而今透過模擬鳥類飛行的VR體驗，可以讓你化身為大冠鷲，在現實與虛幻夾縫中存在的鳳凰谷時空中飛行探索著不可思議的一切。就在飛行的時候，大冠鷲發現了自己最好的朋友──熊鷹，被抓走了！趕快來到科博館，體驗化身為大冠鷲的感覺，沿著遺落下的神秘羽毛軌跡線索去追蹤，找出神隱已久的熊鷹吧！

海上藍寶石探秘-藍洞之旅：藍洞，一個傳說在正中午時刻，會被太陽施下一道魔法，將時空凝結在片刻的神祕藍色洞穴。 藍洞在西吉嶼的西側，是一個與外界完全隔絕的地方。透過VR虛擬實境，你也可以親自揭開藍洞的神秘面紗，體驗被太陽施展魔法後的藍洞，如何變成湛藍色的洞穴與被陽光穿透的海水，感受被時光凍結的神秘時刻。隨著我們潛入陽光穿透的海水中，帶你體驗如何像一隻魚一般，自在地穿梭在一望無際海裡的紫色薰衣草森林，看見巨大的燕魚就在眼前追逐嬉戲，被魚群風暴籠罩的感覺又是多麽的令人震撼。 臺灣是海洋之島，讓我們展開對海洋之島更深入的探索，看見她世界級的美麗。

虛擬蒐藏庫：博物館就像是大自然的時空膠囊，因為有了博物館的收藏與研究，讓我們得以穿越時空的限制，更深刻的了解自己目前身處的文化、環境與這個世界的連結。為了突破館藏文物有限的時間與空間陳列，並且豐富歷史的想像與還原。虛擬蒐藏庫特別精心挑選了古生物、動物、人類、昆蟲各不同學術館藏中的五個主題：鏟齒象、龍王鯨、石虎、三連杯、帝王蝶，提供民眾具有豐富教育意義的互動學習故事。

平衡鷹互動AR：使用者在下載此APP並開啟擴增實境功能後，直接將手機的相機鏡頭對準大冠鷲模型，畫面便會出現一隻翱翔於鳳凰谷鳥園上空的老鷹，欣賞鳳凰谷自然之美景。